As duas palavras existem na língua portuguesa e estão corretas. Como apresentam significados distintos, devem ser utilizadas em situações distintas. Influxo é o termo mais utilizado, apresentando uma variedade de significados. Efluxo é um termo específico da medicina.
O substantivo masculino influxo pode indicar uma afluência ou abundância de algo, bem como uma capacidade de influir ou influenciar. Indica também qualquer tipo de estímulo ou a enchente da maré.
Assim, é sinônimo de afluência, abundância, convergência, concentração, afluxo, influência, ação, estímulo, impulso, inspiração, incentivo, maré-cheia e preamar, entre outros.
Tem sua origem na palavra em latim influxus, sendo escrito com in inicial.
O substantivo masculino efluxo é um termo utilizado na medicina para indicar o escoamento de uma substância líquida para fora de uma cavidade. É um termo muito específico, sem uso fora dessa sua área específica.
Tem sua origem na palavra em latim effluxus, sendo escrito com e inicial.